吉林省水產技術推廣總站為省水利廳直屬處級事業單位。下設辦公室、技術示范科、防疫檢疫與病害防治科、體系建設與培訓科、苗種科、質量安全科、綜合科共計7個科室。為基層水產技術推廣部門、廣大漁農民提供各種技術服務。